Bernd Merbitz wurde in Zumroda, Kreis Schmölln, 1956 geboren. Er absolvierte von 1984 bis 1986 ein Studium an der Hochschule der Deutschen Volkspolizei Berlin mit dem Abschluss als Diplom-Staatswissenschaftler.
Von 1986 bis 1991 leitete er die Morduntersuchungskommission bei der Bezirkspolizeibehörde der Deutschen Volkspolizei. 1991 wurde er Leiter des Dezernats Leben und Gesundheit bei der Bezirkspolizeibehörde Leipzig sowie Leiter der Abteilung Polizeilicher Staatsschutz beim Landeskriminalamt Sachsen.
Bis Ende2004 war er Leiter der Polizeidirektion Grimma und anschließend Polizeipräsidenten der Polizeidirektion Westsachsen.
2007 wurde Bernd Merbitz zum Landespolizeipräsidenten ernannt. Am 2. Juli 2009 wurde er für sein Engagement gegen Extremismus und Fremdenfeindlichkeit vom Zentralrat der Juden mit dem Paul-Spiegel-Preis für Zivilcourage ausgezeichnet.
Im Oktober 2012 wechselte er in die Messestadt Leipzig und trat seinen Dienst als Polizeipräsident in Leipzig an.